La naturaleza de los servicios que se prestan, y de los proyectos que abordan en el seno de Afi, conlleva unas notables exigencias de actualización del conocimiento y de inversión en I+D, que además se manifiesta en el desarrollo de varios proyectos punteros en los últimos años, algunos en colaboración con Universidades y Centros de Investigación Tecnológica, que han gozado del reconocimiento y apoyo de los Programas Nacionales de I+D del Ministerio de Ciencia y Tecnología y de los programas europeos.
A continuación se enumeran algunos de los más relevantes: